文章题目：Organization of the human intestine at single-cell resolution
中文题目：单细胞分辨率下的人类肠道的细胞图谱
期刊：Nature发表时间：2023.7.19
影响因子：64.8 
DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-023-05915-x

2023年7月19日，《Nature》期刊同时发表了3篇论文，首次报道了人体肠道、肾脏和母胎界面（胎盘及其周围母体组织）详细的细胞图谱，这些图谱为后续人体细胞排列方式、细胞间相互作用、疾病治疗等研究提供了重要的参考价值。三篇文章分别是：1.人体肠道细胞图谱：Hickey, J.W., Becker, W.R., Nevins, S.A. et al. Organization of the human intestine at single-cell resolution. Nature 619, 572–584 (2023).  

2.人体肾脏细胞图谱：Lake, B.B., Menon, R., Winfree, S. et al. An atlas of healthy and injured cell states and niches in the human kidney. Nature 619, 585–594 (2023).  

3.人体胎盘细胞图谱：Greenbaum, S., Averbukh, I., Soon, E. et al. A spatially resolved timeline of the human maternal–fetal interface. Nature 619, 595–605 (2023).

第一篇文章：Organization of the human intestine at single-cell resolution，是由来自美国斯坦福医学院生物医学等研究团队，对9个人的8个不同肠道组织部位进行采样，使用单细胞核测序（scRNA-seq）、转座酶染色质可及性单核测序(snATAC-seq)、空间转录组测序（ST-seq）以及使用了一种叫CODEX的成像技术，绘制出了不同肠道区域的细胞组成、基因调控信息和空间分布图谱。

实验小结

1.使用scRNA-seq、snATAC-seq、ST-seq测序手段，结合CODEX的成像技术，在单细胞水平上绘制出了高清的肠道细胞图谱、基因调控信息和空间分布图谱。

2.获取了肠道组织的空间位置信息，还揭示了不同细胞之间和多细胞之间的相互作用，以及免疫细胞在肠道组织中的不同免疫微环境。

3.鉴定出了肠道组织中不同区域的关键基因调节因子（TFs）控制着肠道细胞的分化差异，并将肠道疾病遗传性与特定细胞类型联系起来。

4.总之这项研究鉴定出肠道组织的组成、调节和组织的复杂性，为了解人类生物学研究和疾病治疗提供了重要参考价值。